Помогла, казалось бы, полная переустановка (сначала деинсталляция, потом установка Unity). В итоге перестало зависать, но ровно до тех пор, пока не импортировал в проект UnityVS :(
unity начала виснуть через запуск-два. Даже на новом пустом проекте... оказалось виноват Unity Visual Studio 2015 Tools. Если его не подгружать к проекту, то не виснет. Что могло с ним случиться? Написал им о баге... Пробую переставить. Два часа убил - потерял день разработки... :(